Lipopeptides en biocontrôle : visite de lycéens au BioEcoAgro (Trans-Training)

Les lipopeptides sont des métabolites produits par certaines bactéries du sol et constituent des molécules d’intérêt en biocontrôle et un axe de recherche central au laboratoire BioEcoAgro. Ils sont étudiés pour leur potentiel à contribuer à une protection des cultures plus durable, en proposant des solutions alternatives à certains usages de pesticides de synthèse.

Le 13 février, dans le cadre du projet Trans-Training (portefeuille Biocontrol 4.0) du programme Interreg France-Wallonie-Vlaanderen, nous avons eu le plaisir d’accueillir des élèves de lycée au laboratoire BioEcoAgro à Polytech Lille. Cette visite s’inscrit dans une démarche d’accompagnement d’un potager durable au sein de leur établissement, menée en partenariat entre l’Université de Lille (mission Sciences Avec et Pour la Société) et le Rectorat de Lille.

Au cours de la visite, les élèves ont pu situer leurs propres activités (analyses de sols, expériences menées en TP au lycée, observations) dans un contexte scientifique plus large. Dans les sols, les bactéries contribuent à la fertilité, au recyclage de la matière organique et à la disponibilité des nutriments essentiels. Certaines d'entre elles peuvent également limiter l'installation de microorganismes nuisibles, notamment grâce à la production de métabolites secondaires. Parmi eux, les lipopeptides constituent une famille particulièrement étudiée pour leurs propriétés biosurfactantes et antimicrobiennes, pertinentes en biocontrôle.

Au programme : trois plateformes du laboratoire

Plateforme de microbiologie moléculaire : découverte des espaces et du matériel permettant de manipuler des microorganismes dans de bonnes conditions. Observation de cultures de bactéries et de champignons, exemples de résultats de tests antifongiques et introduction à deux techniques clés en biologie moléculaire : PCR et électrophorèse sur gel d’agarose.

Plateforme de fermentation : présentation du changement d’échelle (du millilitre à des volumes plus importants) pour produire davantage de molécules d’intérêt, dont les lipopeptides. Découverte du rôle d’un fermenteur et des paramètres contrôlés (température, agitation, oxygène, pH).

Plateforme analytique (HPLC) : introduction à la chromatographie liquide haute performance (HPLC) et à l’intérêt des méthodes analytiques pour l’identification, la quantification et la purification des métabolites d’intérêt.

Un kit Interreg remis aux élèves 

À l’issue de la visite, un kit Interreg a été remis aux élèves (un document présentant le projet de recherche du laboratoire BioEcoAgro, des tote bags, un sac à légumes, des notebooks et des flyers Interreg Biocontrol 4.0), afin de valoriser leur engagement et de maintenir un lien concret avec le projet.